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No controle da qualidade da água, tem-se como uma das principais preocupações as florações ou blooms de algas em mananciais de abastecimento de água. Essas algas, que são microrganismos procariontes, aeróbicos e fotoautotróficos, são conhecidas como
Amebas.
Escherichia coli.
Staphylococcus sp..
Cianobactérias.