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A febre Chikungunya é causada pelo vírus RNA que pertence ao gênero Alphavirus da família Togaviridae. Quando o individuo é infectado, as fases nos casos sintomáticos são:
fase pré-aguda, aguda e grave
fase aguda, subaguda e crônica
fase leve, moderada e óbito
fase atípica, típica e aguda