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As Doenças Transmitidas por Alimentos (DTA) envolvem diferentes mecanismos patogênicos e podem ser classificadas, entre outros critérios, em infecções e intoxicações, de acordo com o agente envolvido e o mecanismo de ação, como:
a intoxicação química pode ser do tipo adicionada, como é o caso das micotoxinas, aminas biogênicas e toxinas de algas.
as intoxicações não bacterianas podem ser decorrentes de agrotóxicos ou fungos, envolvendo ação química direta do próprio agente sobre tecidos ou órgãos específicos.
as infecções são causadas pela ingestão de microrganismos patogênicos, podendo ser de dois tipos sem que nenhum dos dois prevaleçam.
um dos tipos de infecção é provocada por microrganismo invasivos, cujo quadro clínico é provocado por toxinas liberadas quando estes se multiplicam.