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Na técnica de impacto de elétrons, comumente a mais usada, um espectrômetro de massas bombardeia moléculas na fase vapor com um feixe de elétrons de alta energia e registra o resultado do impacto dos elétrons como um espectro de íons separados na base da razão massa/carga (m/z). Os espectros de massas usados para a elucidação de estruturas podem ser classificados segundo o método de separação de íons em deflexão em campo magnético como, por exemplo:
Ressonância de íon Cíclotron.
Espectrômetro de massas em sequência.
Filtro de massas quadrupolo.
Focalização dupla.
Captura de íons com quadrupolo.