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Compostos isômeros são aqueles que possuem a mesma composição atômica, contudo apresentam estruturas moleculares diferentes, levando a propriedades físico-químicas distintas entre si. Um exemplo de compostos com isomeria funcional é
CH3CH2OH e CH3OCH3.
CH3CH═CH2 e CH2═CHCH3.
CH3CH2CH2OH e CH3CH(OH)CH3.
CH3CH═CHCH3 (cis) e CH3CH═CHCH3 (trans).
C5H10 (penteno) e C5H10 (ciclopentano).