Seu próximo nível começa aqui
Seu desenvolvimento não pode ter limites. Garanta sua Assinatura Ilimitada e libere uma preparação completa com os melhores professores do Brasil.
Foi realizado um experimento cujo principal objetivo era avaliar a composição do microb...
Foi realizado um experimento cujo principal objetivo era avaliar a composição do microbioma e do resistoma no trato intestinal de modelos animais submetidos a tratamentos com probióticos associados ou não a drogas antimicrobianas convencionais. Duas diferentes drogas foram testadas associadas ou não a um produto probiótico. Ao todo, cinco grupos experimentais foram formados, sendo que cada grupo continha 20 animais. Amostras de fezes, no momento da eutanásia, foram coletadas individualmente, processadas, e o DNA metagenômico foi sequenciado em uma plataforma de NGS (Next Generation Sequencing). A fim de se atingir o principal objetivo do experimento, a estratégia metodológica de sequenciamento mais adequada
A
é a realização do sequenciamento das amostras pela estratégia de Shotgun, em uma profundidade a partir de 10.000.000 de reads, pois possibilitará, com alta confiabilidade, a taxonomia em nível de espécie e a identificação precisa da coleção de genes de resistência a antimicrobianos.
B
é a realização do sequenciamento das amostras pela estratégia de amplificação e sequencimento de amplicons, pois permitirá a identificação do microbioma presente nas fezes dos animais apresentando a taxonomia em nível de espécie para procariotos e eucariotos, assim como a identificação de vírus e a determinação dos genes de resistência a antimicrobianos.
C
é o sequenciamento de amostras pela estratégia de Shotgun, a depender da profundidade e da qualidade das reads geradas, pois possibilitarão a determinação taxonômica do microbioma em nível de espécie e a identificação de genes de resistência a antimicrobianos.
D
é o sequenciamento de amplicons, levando em conta o custo e o tempo dispendidos nas análises, construindo quatro bibliotecas para cada amostra: uma com amplicons bacterianos, uma com amplicons eucarióticos, uma com amplicons virais e uma com amplicons de genes marcadores de resistência a antimicrobianos.
E
é o emprego do sequenciamento por Shotgun, para assim identificar o microbioma, associado ao sequenciamento de amplicons, para identificar o resistoma.