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Essencialmente os containers servem para que possamos isolar processos em um sistema operacional. No uso de containers não temos um Hypervisor, o kernel linux se encarrega de isolar o processo utilizando recursos nativos. No linux, atuam no isolamento do container, dando ao container uma visão de um filesystem:
Namespaces.
SecComp.
SELinux.
AppArmour.
CGROUPS.