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É função do auxiliar veterinário preparar o paciente, verificando se seu estado geral está bom e realizando a tricotomia e limpeza da região que será abordada cirurgicamente. Com o animal já anestesiado e posicionado na mesa de cirurgia, é feita a antissepsia da superfície corpórea, que consiste em:
Uso de povidine degermante, enxague com solução fisiológica e depois uso de povidine tópico.
Uso de água oxigenada, enxague com povidine e uso de álcool 70%.
Uso de clorexidine tópico, enxague com água oxigenada e uso de povidine tópico.
Uso de hipoclorito de sódio em duas etapas.
Uso de povidine tópico, enxague com álcool iodado e uso de povidine degermante.