Conforme o Estatuto da UFC, a administração superior será exercida através dos seguintes órgãos:
Conselho Universitário, Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão e Reitoria.
Conselho de Curadores e Conselho Fiscalizador e de Gestão.
Conselho de Diretores de Unidades.
Conselho de Pró-Reitores.