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É uma desvantagem do método de água duplamente marcada para medida do gasto energético:
Não reflete a atividade física usual do indivíduo.
É limitada para indivíduos com doença renal crônica.
Não permite aferir medidas de gasto energético por longos períodos.
É realizada durante a prática do exercício físico.
É realizada em pacientes internados em Unidade de Terapia Intensiva.