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A coleta de amostras é um dos procedimentos mais importantes para a avaliação da área de estudo; dessa forma é imprescindível que as amostragens sejam realizadas com muito cuidado e esmero e principalmente com uma técnica apurada para que não ocorra nenhum tipo de contaminação e perdas, e assim representar de forma precisa o corpo d’água. Dentre as classificações pela Agência Nacional de Águas, a que se enquadra como Coleta de amostra Classe D é:
amostras de água tratada.
amostras de água bruta.
amostras de água residuária.
amostras de materiais biológicos.
amostras de solo, sedimento, lodo, material sólido de dragagem, resíduo sólido e semissólido em geral.