Questões de Concurso sobre Biologia molecular

 
 
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O preparo de bibliotecas genômicas é uma etapa fundamental para o sucesso do sequenciamento, seja ele voltado à análise genômica, transcriptômica ou metagenômica. Cada tipo de amostra requer protocolos específicos de fragmentação, purificação e ligação de adaptadores. A compreensão das diferenças entre esses procedimentos é essencial para interpretar os resultados de experimentos de RNA-seq, metagenômica e NGS em geral. Analise as assertivas abaixo sobre diferentes estratégias empregadas na construção de bibliotecas de DNA e RNA, assinalando V, se verdadeiras, ou F, se falsas.


( ) Na construção de bibliotecas metagenômicas, o DNA obtido de múltiplas espécies precisa ser fragmentado aleatoriamente.

( ) Durante o preparo de bibliotecas de cDNA para RNA-seq, a fragmentação enzimática permite o controle mais preciso do tamanho médio dos fragmentos.

( ) A vantagem de construir uma biblioteca de DNA de fita dupla garante a cobertura de DNA mitocondrial.

( ) Durante a conversão de RNA em cDNA, o uso de transcriptase reversa é fundamental para promover a ligação covalente entre adaptadores e RNA.

( ) Durante o preparo de bibliotecas de RNA-seq, o uso de oligo(dT) serve para selecionar RNA mensageiro por hibridização à cauda poli(A).


A ordem correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é:


A

F – V – V – F – F.


B

V – V – F – F – V.


C

V – F – V – F – V.


D

F – V – F – V – F.


E

V – F – F – V – V.

Durante a repressão transcricional em eucariotos, a regulação da cromatina desempenha papel central na modulação da acessibilidade do DNA à maquinaria de transcrição. Diversos complexos podem interagir com fatores de transcrição, alterando o estado estrutural da cromatina e interferindo na expressão gênica. Sobre o tema, assinale a alternativa correta.


A

A acetilação de histonas aumenta a carga positiva dos resíduos de lisina, fortalecendo a interação entre DNA e histonas e promovendo a repressão transcricional.


B

A desacetilação de histonas, mediada por HDACs, reduz a acessibilidade do DNA e favorece o recrutamento de proteínas compactadoras de cromatina.


C

A metilação de histonas ocorre em resíduos de lisina e resulta invariavelmente na ativação transcricional.


D

A abertura da cromatina depende exclusivamente da ação de helicases associadas a fatores repressivos.


E

A repressão transcricional ocorre apenas por bloqueio físico do sítio de ligação da RNA polimerase II, sem participação de modificações pós-traducionais em histonas.

A fim de compreender os mecanismos genéticos associados à altura e ao alongamento do caule em uma determinada população de Arabidopsis thaliana adaptada a temperaturas mais elevadas, pesquisadores estão estudando o papel do gene AtGA20ox1, utilizando o sistema CRISPR-Cas9. Durante o planejamento do desenho experimental, os pesquisadores observaram a necessidade da presença de uma pequena sequência adjacente ao alvo, denominada protospacer adjacent motif (PAM). No contexto do CRISPR-Cas9, assinale a alternativa correta sobre a sequência PAM.


A

É utilizada para o reconhecimento de uma sequência de DNA exógeno por mecanismos de reparo


B

Determina o local de inserção de indels via HDR.


C

Define a posição exata onde ocorrerá a inserção do molde de reparo.


D

Atua como região complementar ao RNA guia, facilitando o pareamento.


E

É obrigatória para o reconhecimento e clivagem do DNA-alvo.

Comparando Northern blot, RT-qPCR e RNA-seq, considere alcance global, limite de detecção e resolução estrutural (isoformas/splicing). Com base em Alberts et al., 2022; Mortazavi et al., 2008; Bustin et al., MIQE, qual proposição é rigorosamente correta?


A

RNA-seq mede padrões locais mas não discrimina splicing alternativo, já que os reads curtos não cobrem junções de exons com fidelidade robusta.


B

Northern supera RT-qPCR em sensibilidade para baixa abundância, dispensando amplificação, e fornece quantificação absoluta sem padrões externos.


C

RNA-seq limita-se a genes anotados, não detectando transcritos novos ou junções exóticas, devido ao viés de mapeamento ao genoma de referência.


D

RT-qPCR quantifica globalmente sem primers direcionados, pois o melting curve distingue todos os transcritos por picos térmicos específicos universais.


E

RT-qPCR requer síntese de cDNA e quantifica transcritos específicos com alta sensibilidade, mas não recupera isoformas globais sem primers/sondas desenhados a priori.

Os testes bacteriológicos avançados permitem classificar cepas patogênicas a partir de marcadores genéticos específicos. Indique a alternativa CORRETA:


A

A aplicação de sondas de DNA para Salmonella e Shigella compromete a identificação, pois espécies entéricas não apresentam variação genômica.


B

A análise de colônias em ágar sangue prescinde de recursos moleculares, já que a hemólise beta garante tipagem definitiva.


C

A hibridização de fragmentos complementares ao gene rRNA 16S apoia a caracterização, possibilitando determinar a linhagem bacteriana com maior confiabilidade.


D

A clonagem de plasmídeos presentes em Escherichia coli não contribui para determinar perfis de virulência, pois os plasmídeos não transportam genes relevantes.

O sequenciamento de nova geração (NGS) permite analisar simultaneamente milhões de fragmentos de DNA, sendo mais eficiente que o sequenciamento de Sanger em larga escala.


C

Certo


E

Errado

Em 2003, o Projeto Genoma Humano entregou um genoma 100% completo, incluindo centrômeros e telômeros.


C

Certo


E

Errado

A degradação do material genético em protocolos de extração de DNA pela metodologia de fenol-clorofórmio geralmente está relacionada a


A

presença residual de RNAse.


B

contaminação por proteínas.


C

exposição a DNAses endógenas não inativadas.


D

excesso de fenol, provocando a estabilização de fragmentos curtos.


E

uso de tampão EDTA, que impede a correta precipitação do DNA.

A integração entre tecnologia microfluídica e MEMS (sistemas microeletromecânicos) tem impulsionado o desenvolvimento de dispositivos de PCR miniaturizados.


Assinale a alternativa que descreve corretamente uma característica associada a esses dispositivos.


A

Dependem exclusivamente de fontes elétricas estáveis, inviabilizando seu uso em regiões remotas.


B

Operam em baixa velocidade, incompatível com diagnósticos urgentes.


C

Exigem grande volume de amostra para processamento.


D

São restritos ao uso em laboratórios centrais com infraestrutura robusta.


E

Apresentam alta portabilidade com possibilidade de uso em campo.

A utilização de episódios históricos no ensino de Biologia pode proporcionar uma compreensão mais contextualizada do processo de construção do conhecimento científico. Nesse cenário, um professor de Biologia elaborou uma proposta de aula com um desafio: conhecer a história da descoberta do DNA como uma construção social. A atividade consistia em abordar a intensa competição entre laboratórios e as questões éticas envolvidas na corrida pela descoberta, bem como a reflexão sobre a ausência de figuras femininas proeminentes nas narrativas tradicionais. Como forma de enfrentamento dessa questão, destacou o papel de Rosalind Franklin, cujo trabalho com difração de raios X foi essencial para a elucidação da estrutura do DNA, mas que muitas vezes é invisibilizado tanto em registros históricos como em livros didáticos. Na história do DNA, o trabalho científico desenvolvido por essa cientista não foi valorizado e a propriedade intelectual das suas atividades foi transferida para outros cientistas.


A alternativa que apresenta a estratégia coerente com os objetivos do planejamento do professor é a


A

descrição da estrutura da molécula do DNA e a compreensão das funções de armazenamento, transmissão e replicação da informação genética.


B

discussão das aplicações sociais do conhecimento sobre o DNA e das suas implicações éticas nas áreas da Medicina, da Agricultura e da Ciência Forense.


C

caracterização de que a ciência é um empreendimento humano e que aspectos sociais da construção do modelo do DNA são frutos de um processo histórico.


D

apresentação da estrutura básica da dupla hélice do DNA e das contribuições de diversos cientistas para o sequenciamento e o mapeamento do genoma humano.

As técnicas de amplificação de DNA transformaram a biologia molecular e o diagnóstico clínico. Desde a PCR convencional de Mullis (1985) até as versões em tempo real (qPCR) e digital, a capacidade de detectar sequências específicas ampliou a precisão analítica. Segundo Brown (2016) e Alberts et al. (2022), cada variante apresenta vantagens metodológicas e aplicações distintas. Qual proposição reflete de forma mais consistente esse panorama?


A

A qPCR permite quantificação em tempo real por emissão de fluorescência, enquanto a PCR digital realiza particionamento da amostra, possibilitando quantificação absoluta de cópias sem depender de curvas de calibração.


B

A PCR convencional possibilita quantificação absoluta por fluorescência direta, ao passo que a qPCR baseia-se apenas em análise final por eletroforese, sem capacidade de quantificação relativa ou absoluta.


C

A PCR digital é incapaz de fornecer quantificação precisa, pois o particionamento compromete a sensibilidade, sendo restrita a análises qualitativas de presença ou ausência de sequências.


D

A qPCR apresenta menor especificidade que a PCR convencional, dado que os fluoróforos reduzem a acurácia, sendo preferível apenas para análises preliminares de sequenciamento.


E

A PCR convencional substitui a PCR digital em diagnósticos clínicos de alta precisão, pois a ausência de particionamento e de fluorescência direta aumenta a reprodutibilidade quantitativa.

Conhecer a composição química do material genético e compreender como ele funciona, é fundamental para a prevenção e solução de várias questões relacionadas à saúde, ao bem-estar e ao meio ambiente.


Com relação a esse tema, avalie as afirmativas a seguir e assinale (V) para a verdadeira e (F) para a falsa.


( ) A molécula de DNA é composta por uma dupla cadeia de polinucleotídeos; cada nucleotídeo é formado por uma base nitrogenada, um açúcar e um fosfato. Em uma fita única de DNA, a ligação entre os nucleotídeos se faz entre o açúcar de um nucleotídeo e a base nitrogenada do seguinte.

( ) Um organismo multicelular complexo, como o humano, é formado por muitos tipos de células. Por exemplo, um neurônio e uma célula muscular de uma mesma pessoa, embora tenham igual número de cromossomos, são diferentes, pois seus genes não são os mesmos.

( ) Fatores do ambiente, como certos tipos de alimentos e poluentes, podem influenciar a expressão dos genes de um indivíduo, ativando-os ou inativando-os, sem alterar a sequência de bases do DNA.


As afirmativas são, respectivamente,


A

F – V – F.


B

F – F – V.


C

V – F – F.


D

V – V – F.


E

F – V – V.

Sobre o “dogma central” expandido e regulação da expressão, analise as afirmativas.


I. RNAs não codificadores podem modular transcrição, estabilidade e tradução de mensageiros.

II. Splicing alternativo amplia o repertório proteico a partir de um único locus.

III. Edição de RNA altera bases específicas e pode ajustar função sem modificação do DNA.

IV. Modificações epigenéticas como metilação e acetilação modulam acessibilidade cromatínica e expressão.

V. Tráfego de fatores transcricionais independe de sinais de localização e gradientes celulares.


Estão corretas as afirmativas:


A

I, II e III, apenas.


B

I, II, III e IV, apenas.


C

III e IV, apenas.


D

II, III e V, apenas.


E

I, II, III, IV e V.

A biologia estrutural, segundo Branden & Tooze (1999), constitui campo interdisciplinar que correlaciona arquitetura tridimensional de macromoléculas com suas funções biológicas, utilizando metodologias como cristalografia de raios X, criomicroscopia eletrônica, ressonância magnética nuclear e modelagem molecular. Esses recursos permitem correlacionar organização atômica com dinâmica conformacional e funções fisiológicas, fornecendo subsídios para biotecnologia e farmacologia. Nesse panorama, qual proposição traduz de forma mais integrativa as aplicações desse domínio científico?


A

A cristalografia de raios X detalha proteínas cristalizadas, permitindo compreensão estrutural de alta resolução e orientando projetos de fármacos baseados em interação molecular.


B

A criomicroscopia eletrônica permite análise de grandes complexos macromoleculares em condições próximas às nativas, com resolução quase atômica em determinados casos.


C

A RMN de proteínas solúveis descreve estruturas em solução, revelando conformações alternativas e flexibilidade estrutural em múltiplos contextos.


D

A modelagem molecular por homologia projeta estruturas tridimensionais com base em proteínas conhecidas, apoiando hipóteses funcionais em investigações comparativas.


E

A integração de múltiplas técnicas possibilita abordagem abrangente, correlacionando arquitetura, dinâmica e função molecular em sistemas biológicos complexos e aplicações biomédicas.

A replicação do DNA é um processo essencial para a perpetuação da informação genética. Embora os princípios gerais desse processo sejam conservados em todos os organismos, existem diferenças significativas entre procariontes e eucariontes relacionadas à estrutura genômica, à complexidade celular e à maquinaria enzimática envolvida. Sobre biologia molecular, analise as assertivas abaixo e assinale V, se verdadeiras, ou F, se falsas.


( ) Tanto em procariontes quanto em eucariontes, a replicação do DNA é semiconservativa e iniciada por primers de RNA sintetizados por uma primase (RNA polimerase), que são posteriormente removidos e substituídos por DNA.

( ) Enquanto os procariontes possuem uma única origem de replicação por cromossomo circular, os eucariontes apresentam múltiplas origens de replicação ao longo de seus cromossomos lineares.

( ) A enzima helicase atua separando as fitas de DNA em ambas as células, e a topoisomerase atua removendo a supertorção; porém, essas enzimas são exclusivas de procariontes, dada a estrutura circular do seu DNA.

( ) Em procariontes, a replicação na dupla hélice ocorre de forma contínua e bidirecional ao redor do cromossomo circular; já em eucariontes, há síntese contínua na fita principal e descontínua na fita molde oposta, gerando os fragmentos de Okazaki.

( ) Apenas os eucariontes requerem a ação da telomerase, que impede a perda de informações genômicas após cada rodada de replicação do DNA, pois os cromossomos lineares apresentam extremidades que não podem ser totalmente replicadas pela DNA polimerase.


A ordem correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é:


A

V – F – V – F – F.


B

F – V – V – F – V.


C

V – F – F – V – V.


D

F – V – F – V – F.


E

V – V – F – F – V.

A Reação em Cadeia da DNA Polimerase, mais conhecida pela sigla PCR, é uma técnica que revolucionou diversas áreas da ciência. Dentre seus empregos e etapas, é correto afirmar que:


A

a PCR convencional utiliza sondas marcadas com fluoróforos para a quantificação dos produtos de amplificação.


B

três etapas compõem a técnica, sendo a primeira chamada de anelamento ou de hibridização, consistindo na ligação dos iniciadores.


C

a transcriptase reversa é a enzima responsável pelo processo de amplificação do fragmento de DNA alvo na reação de PCR,


D

enzimas termoestáveis derivadas de bactérias termofílicas, como a espécie Thermus aquatics, são úteis para o desenvolvimento da técnica.


E

géis de agarose são empregados na análise das reações de PCR em tempo real, pois permitem a visualização do processo. Não se aplicam ao PCR convencional.

Marcadores moleculares são sequências de DNA que apresentam polimorfismos entre indivíduos geneticamente relacionados. Esses marcadores foram responsáveis pelo desenvolvimento dos primeiros mapas genéticos de muitas espécies que cultivamos, além da descoberta de genes e de inúmeros estudos de diversidade genética. Além disso, eles são amplamente utilizados para estudo populacional, mapeamento e análises de similaridade, filogenia, diagnósticos de doenças genéticas, testes de paternidade, entre outras tantas aplicações. O desenvolvimento de marcadores moleculares para a detecção de polimorfismos de DNA tem revolucionado a genética molecular. Considerando a ampla caracterização dos marcadores genéticos, relacione a Coluna 1 à Coluna 2, associando os marcadores genéticos às suas definições.


Coluna 1

1. SSR.

2. SNP.

3. RFLP.

4. AFLP.


Coluna 2

( ) Podem ser causados por mudanças de pares de bases, rearranjo de DNA, inserção e/ou deleção ou diversidade natural na sequência de nucleotídeos entre ou dentro de populações.

( ) Constituem um dos mais recentes marcadores de DNA e combinam a digestão enzimática com amplificação seletiva por PCR (semelhante ao RAPD).

( ) Consistem em pequenas sequências com 1 a 6 nucleotídeos de comprimento, repetidas em tandem.

( ) Variação em um único par de bases do nosso cromossomo.


A ordem correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é:


A

4 - 3 - 1 - 2.


B

3 - 4 - 2 - 1.


C

1 - 2 - 4 - 5.


D

3 - 4 - 1 - 2.


E

1 - 2 - 3 - 4.

Doenças genéticas podem ser causadas por mutações no DNA que afetam a estrutura ou função de proteínas.


Assinale a alternativa correta sobre o papel da biologia molecular no diagnóstico dessas doenças.


A

O estudo do histórico familiar é suficiente para diagnosticar doenças genéticas, sem necessidade de técnicas de biologia molecular.


B

A mutação em um gene sempre resulta em uma doença hereditária que será transmitida a todas as próximas gerações.


C

Técnicas de biologia molecular permitem identificar mutações específicas no DNA, facilitando o diagnóstico e tratamento personalizado.


D

O RNA mensageiro é responsável pela replicação do DNA nas células, portanto, é a principal molécula estudada para diagnóstico genético.


E

A coloração de células sanguíneas é o método mais eficaz para detectar mutações genéticas.

Acerca da estrutura da molécula de ácido desoxirribonucleico (DNA), analise as assertivas e assinale a alternativa que aponta as corretas.


I. O "esqueleto" de cada cadeia de DNA é formado pela alternância de açúcar (desoxirribose) e fosfato.

II. As duas cadeias da dupla-hélice são mantidas unidas por ligações de hidrogênio formadas entre os grupos fosfato e o açúcar desoxirribose.

III. O pareamento de bases no interior da dupla-hélice obedece à regra de complementaridade, sendo que a base adenina (A) forma par exclusivamente com a timina (T), e a guanina (G) com a citosina (C).

IV. A polaridade de uma fita de DNA é oposta à da outra fita, sendo essa disposição antiparalela essencial para o encaixe correto dos pares de bases na dupla-hélice.


A

I e II, apenas.


B

I, III e IV, apenas.


C

II e III, apenas.


D

I, II e IV, apenas.


E

I, II, III e IV.

A hibridização in situ fluorescente (FISH) é uma técnica utilizada para identificar mutações pontuais em nucleotídeos específicos do DNA.


C

Certo


E

Errado

   
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